Sintesi

FoundationOne®CDx è un servizio di Comprehensive Genomic Profiling, certificato, su tessuto, per tutti i tipi di tumori solidi, in grado di individuare alterazioni in 324 geni correlati al tumore e Genomic Signatures come TMB e MSI.1-3
Rilevamento dei biomarker

FoundationOne®CDx può aiutarvi a identificare le opzioni terapeutiche individuando le alterazioni genomiche presenti in 324 geni, associate al tumore e riconducibili alle 4 principali classi di alterazioni genomiche.1,3 FoundationOne®CDx è inoltre in grado di rilevare i biomarcatori di instabilità dei microsatelliti (MSI) ed il carico mutazionale del tumore (TMB), biomarcatori la cui valutazione può permettere di identificare meglio i pazienti che possono beneficiare maggiormente dell’immunoterapia.1,3                                         

 

FoundationOne®CDx è in grado di individuare 4 classi di alterazioni genomiche in aggiunta ai biomarcatori associati alla risposta all’immunoterapia1,3

Maggiore precisione

FoundationOne®CDx è leader nel Comprehensive Genomic Profiling poiché è in grado di rilevare un numero superiore di alterazioni rispetto ad altri metodi di analisi.4-7

Rispetto a molte altre tecniche come l’ibridazione in situ in fluorescenza (FISH) e l’immunoistochimica (IHC), FoundationOne®CDx offre livelli di rilevazione migliori poiché utilizza la tecnica Next Generation Sequencing basata su Hybrid Capture per sequenziare le intere regioni codificanti di centinaia di geni notoriamente correlati al tumore, fornendo un’elevata “coverage” uniforme in tutti i geni sequenziati, e garantendo con un’alta sensibilità l’identificazione di alterazioni comuni e rare.4-8

Il servizio fornisce risultati rapidi, dando la possibilità ai medici di intervenire tempestivamente. Il Comprehensive Genomic Profiling di FoundationOne®CDx è supportato, inoltre, da una delle banche dati genomiche più complete del mondo e si avvale di esperti del campo a livello globale, garantendo un report esaustivo e di alta qualità.

FoundationOne®CDx permette di ampliare le capacità diagnostiche e le opzioni terapeutiche, identificando le alterazioni genomiche clinicamente rilevanti che altre tecniche standard potrebbero non rilevare.5-7, 9-12
Le tecniche standard, come l’immunoistochimica (IHC), continuano a rivestire un ruolo importante nella diagnosi di alcuni tipi di tumore, ad esempio quando è richiesta l’analisi di un unico biomarcatore per determinare la presenza o l’assenza di specifiche alterazioni associate al buon esito del trattamento con una terapia approvata. Il Comprehensive Genomic Profiling offre la possibilità di rilevare molteplici biomarcatori e alterazioni contemporaneamente, senza necessità di una predeterminazione dei bersagli (ossia, i bersagli sono noti prima dell’analisi). Questi test sono particolarmente utili nei casi in cui potrebbe essere meno chiaro cosa analizzare.5-7, 9-12
FoundationOne®CDx in grado di identificare le alterazioni presenti in diversi tipi di tumore.3

FoundationOne®CDx fornisce un servizio di Comprehensive Genomic Profiling, quindi non è necessario specificare anticipatamente un’alterazione di interesse. È dimostrato che la maggior parte delle alterazioni di potenziale rilevanza clinica può sfuggire utilizzando approcci di profilazione tradizionali che analizzano alterazioni predefinite in base alle aspettative dei medici.5-7, 9-12 In uno studio condotto su circa 7.300 campioni di tumori solidi, è stato analizzato il potenziale beneficio della terapia mirata per note alterazioni dell’oncogene ERBB2 (noto anche come HER2), comuni nel tumore mammario, gastrico e gastroesofageo (GE). In questo studio, alterazioni di ERBB2 sono state rilevate in 27 diversi tipi di tessuto e le alterazioni nell’amplificazione di ERBB2, rilevate nei tumori della giunzione GE, della mammella e dello stomaco, hanno rappresentato solo il 30% di tutte le alterazioni note dell’oncogene ERBB2 rilevate.6

Il Comprehensive Genomic Profiling ha portato alla rilevazione di alterazioni genomiche del tipo sostituzioni di basi, riarrangiamenti, inserzioni/delezioni e amplificazioni nell’intera gamma di tipi di tumore analizzati. I risultati di questo studio evidenziano il fatto che, rispetto agli attuali standard clinici, il Comprehensive Genomic Profiling potrebbe identificare in modo più accurato i pazienti che trarrebbero beneficio dalle terapie mirate contro ERBB2.*6L’esecuzione di un’analisi NGS con hybrid capture ha portato alla rilevazione di alterazioni genomiche del tipo sostituzioni di basi, riarrangiamenti, inserzioni/delezioni e amplificazioni nell’intera gamma di tipi di tumore analizzati. I risultati di questo studio evidenziano il fatto che, rispetto agli attuali standard clinici, la profilazione genomica esaustiva potrebbe identificare in modo più accurato i pazienti che potrebbero trarre beneficio dalle terapie mirate contro ERBB2.**7

Pazienti nei quali si potrebbero rilevare alterazioni di rilievo clinico ricorrendo al Comprehensive Genomic Profiling [6]
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FoundationOne®CDx fornisce un Comprehensive Genomic Profiling in grado di identificare un numero maggiore di alterazioni rispetto all’analisi NGS hotspot.8,17,18

L’approccio Comprehensive Genomic Profiling di Foundation Medicine® massimizza l’utilità clinica di NGS.3,4

Non tutte le piattaforme Next Generation Sequencing (NGS) analizzano il genoma ampiamente per rilevare tutti i tipi di alterazioni.4,7,17,18

L’analisi NGS hotspot (basata su ampliconi) sequenzia soltanto regioni o “cluster” di geni che sono notoriamente associati all’insorgenza dei tumori. Sebbene più esaustiva delle tecniche di ibridazione in situ in fluorescenza (FISH) o di reazione a catena della polimerasi-trascrittasi inversa (RT-PCR), questa tecnica fornisce un’analisi limitata e si stima che, senza un’analisi FISH integrativa, un pannello di geni hotspot potrebbe non rilevare fino al 50% delle alterazioni clinicamente rilevanti di cui è raccomandata l’analisi da parte delle linee guida NCCN.17 Inoltre, questo tipo di analisi generalmente identifica sostituzioni di basi con un’elevata sensibilità, ma è in grado di rilevare solo piccole inserzioni e delezioni con una sensibilità bassa.18 Molte alterazioni potrebbero quindi non essere rilevate durante un’analisi NGS hotspot rispetto a FoundationOne®CDx, che offre un approccio di Comprehensive Genomic Profiling (Hybrid Capture) di >99% delle sequenze codificanti di molti geni correlati al tumore.3,8

Inoltre, FoundationOne®CDx rileva TMB e MSI, la cui valutazione può permettere di identificare i pazienti che possono aver maggior beneficio dall’immunoterapia.1,3

MULTIGENE HOTSPOT TEST
L’analisi “multigene hotspot” sequenzia regioni specifiche di un gene, per questo molte alterazioni genetiche non sono rilevate.[18]
Comprehensive Genomic Profiling
Il Comprehensive Genomic Profiling di Foundation Medicine® utilizza la tecnica di Next Generation Sequencing per rilevare le quattro principali classi di alterazioni genomiche così come i biomarcatori che aiutano a predire la risposta all’immunoterapia.[3,7,8,19,20]
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È stato provato in diversi studi che il Comprehensive Genomic Profiling di Foundation Medicine® permette di identificare una maggior quantità di alterazioni del DNA rispetto all’analisi NGS hotspot:

Pazienti con carcinoma polmonare non a piccole cellule (NSCLC)
Il 17% (12/71) dei pazienti che risultano positivi a una delezione dell’esone 19 di EGFR era precedentemente risultato negativo con l’analisi NGS hotspot.4
Casi di NSCLC
Senza un’analisi FISH integrativa, l’analisi hot spot potrebbe non rilevare fino al 50% delle alterazioni target che linee guida del National Comprehensive Cancer Network (NCCN) raccomandano di analizzare con la profilazione molecolare.17
Casi di tumore del colon-retto
L’88% delle alterazioni di KRAS predittive situate fuori dalla regione hotspot del codone 12/13 era sfuggito alla precedente analisi hotspot.21
Validazione/Approvazione FDA

FoundationOne®CDx è un servizio di Comprehensive Genomic Profiling validato analiticamente e clinicamente approvato dalla FDA.1,22
Workflow analizzato e approvato dalla FDA[3]
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Oltre 120 volte più campioni di una normale validazione[22,23]
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Secondo l’indicazione dello Stato di New York. I numeri sono approssimati e includono campioni e linee cellulari.

Oltre la validazione analitica

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Quali geni vengono analizzati utilizzando FoundationOne®CDx?

FoundationOne®CDx identifica tutte le classi di alterazioni in ciascun gene elencato nelle tabelle sottostanti.

Da rif. 26

cod. IT/NONP/1804/0001(2)
Riferimenti
  1. FoundationOne®CDx autorizzazione FDA 2017. Disponibile su: https://www.accessdata.fda.gov/cdrh_docs/pdf17/P170019a.pdf (Consultato nell'agosto 2018).
  2. FoundationOne®CDx autorizzazione FDA 2017. Disponibile su: https://www.fda.gov/NewsEvents/Newsroom/PressAnnouncements/ucm587273.htm (Consultato nell'agosto 2018).
  3. FoundationOne®Cdx specifiche tecniche. Disponibili su: www.rochefoundationmedicine.com/f1cdxtech.
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  26. FoundationOne®CDx esempio di report, 2018. Disponibile su: www.rochefoundationmedicine.com/reporting